Rastreamento de Câncer de Colo de Útero
0.0.1 - preliminar
Rastreamento de Câncer de Colo de Útero, published by Comissão de Governança de Informação em Saúde (CGIS - UFG). This guide is not an authorized publication; it is the continuous build for version 0.0.1 built by the FHIR (HL7® FHIR® Standard) CI Build. This version is based on the current content of https://github.com/kyriosdata/farol/ and changes regularly. See the Directory of published versions
Esta página oferece orientações para o desenvolvedor de software responsável pela integração com o SISCAN, via FHIR, conforme definido pelo presente Guia.
Neste processo, instâncias precisam ser construídas (Criação de instâncias) e validadas (Validação de instâncias). Naturalmente precisam ser enviadas (Submissão de requisições) e, para tal, um servidor FHIR pode ser disponibilizado (Disponibilizando um servidor FHIR).
A informação em saúde correspondente a uma requisição ou laudo de exame citopatológico precisa ser “empacotada” em uma instância do recurso Bundle. Uma requisição e um laudo ilustram o tipo de instância que precisa ser construída. Há muitos exemplos no formato de sua preferência, XML, JSON ou TTL. Você pode empregá-los para se familiarizar com o payload de requisições e laudos citopatológicos.
A construção das instâncias de requisição e de laudo, citadas acima, é ilustrada por código. Consulte clientes para exemplos.
Para verificar se a montagem de instância atende as exigências do Guia, veja as orientações abaixo.
java -jar validator_cli.jar -version 4.0.1 -ig package.tgz Bundle-bruna-requisicao.json
. O resultado produzido pelo validador indica a conformidade ou não da instância de recurso FHIR fornecida.Os passos sugeridos acima podem ser executados conforme abaixo:
http --download https://github.com/hapifhir/org.hl7.fhir.core/releases/latest/download/validator_cli.jar > validator_cli.jar
http --download https://build.fhir.org/ig/kyriosdata/farol/package.tgz > package.tgz
http --download https://build.fhir.org/ig/kyriosdata/farol/Bundle-bruna-requisicao.json > Bundle-bruna-requisicao.json
java -jar validator_cli.jar -version 4.0.1 -ig package.tgz Bundle-bruna-requisicao.json
O último comando requisita a validação, cuja parte final do resultado produzido é fornecido abaixo, em particular, a indicação de que nenhum erro, nem mesmo um aviso foi gerado pela validação da requisição que, desta forma, encontra-se em conformidade com o definido pelo Guia.
Validate Bundle against http://hl7.org/fhir/StructureDefinition/Bundle|4.0.1..........20..........40..........60..........80.........|
00:14.263
Done. Times: Loading: 00:30.054, validation: 00:14.263. Memory = 1Gb
Success: 0 errors, 0 warnings, 1 notes
Information: All OK
Done. Times: Loading: 00:30.054, validation: 00:14.263. Max Memory = 11Gb
fabio@s130:/tmp/teste$
O servidor HAPI FHIR pronto para testes pode ser exercitado de várias formas.
Para submeter uma instância do recurso Bundle, contendo uma requisição ou um laudo, o comando é o mesmo, conforme abaixo.
http http://localhost:8080/Bundle < instancia.json
Há um conjunto de requisições disponíveis no Postman (aqui).
Para gerar um servidor FHIR para testes, a partir do código fonte, siga os passos abaixo.
git clone https://github.com/hapifhir/hapi-fhir-jpaserver-starter.git
cd hapi-fhir-jpaserver-starter
mvn package spring-boot:repackage -Pboot -DskipTests
Os comandos acima produzem o arquivo ROOT.war (implementação do Servidor HAPI FHIR) no diretório hapi-fhir-jpaserver-starter/target
. Copie este arquivo para o seu diretório de trabalho, digamos, hapi
.
A configuração do servidor HAPI FHIR contemplando o presente Guia está disponível no arquivo application.properties.
http --download https://build.fhir.org/ig/kyriosdata/farol/application.properties > application.properties
O conteúdo deste arquivo é fornecido abaixo. Observe que são definidas duas dependência, uma para o conteúdo do presente Guia e outra para o NPM Package br.ufg.cgis.rnds-lite. Este último contém perfis utilizados pela RNDS.
management.endpoint.endpoints.enabled-by-default=false
management.endpoints.web.exposure.include=*
hapi.fhir.fhirpath_interceptor_enabled=true
hapi.fhir.implementationguides.rnds.name=br.ufg.cgis.rnds-lite
hapi.fhir.implementationguides.rnds.version=0.2.1
hapi.fhir.implementationguides.rnds.installMode=STORE_AND_INSTALL
hapi.fhir.implementationguides.ccu.name=br.gov.saude.ccu
hapi.fhir.implementationguides.ccu.version=0.0.1
hapi.fhir.implementationguides.ccu.packageUrl=https://build.fhir.org/ig/kyriosdata/farol/package.tgz
hapi.fhir.implementationguides.ccu.installMode=STORE_AND_INSTALL
Copie o arquivo ROOT.war e application.properties para um mesmo diretório e, neste diretório, execute o comando abaixo.
java -jar ROOT.war
Após o início do servidor a configuração é concluída com os passos abaixo.
http --download https://build.fhir.org/ig/kyriosdata/farol/Questionnaire-anamnese-exame-citopatologico.json > Questionnaire-anamnese-exame-citopatologico.json
http http://localhost:8080/fhir/Questionnaire < Questionnaire-anamnese-exame-citopatologico.json